Som selvejende institution har LM's Børnehus både en institutionsbestyrelse og en forældrebestyrelse. Institutionsbestyrelsen består af 6 personer og er børnehusets øverste ledelse.
Institutionsbestyrelse
Hanne Nymann Eriksen (formand)
Dorthe Rejkjær Holm (næstformand)
Louise Kildeholm Jensen (medlem)
Katja Ingemann Roosevelt (medlem)
Tina Larila Gørløv (medlem)
Lykke Toft (medarbejderrepræsentant)
Forældrebestyrelse
Katja Ingemann Roosevelt (formand)
Tina Larila Gørløv (næstformand)
Cecilie Hallwass Kofod ( medlem )
Lykke Toft (medarbejderrepræsentant)